严老师，您好!
我现在学着做fmri的数据处理。我有一批fmri的数据，有一下几个问题，希望您能该给予指导：
1、这批数据每个被试有80个时间点，TR为3秒，这样采样时间就4分，记得您在教程中回答过一个问题，一般采数据至少要5分钟才有实用性，您看我这批数据可用吗？
2、以前我用basic edition dparsf来处理数据，因为我的数据时飞利浦机器采的，头动较大，要进行头动的注意矫正，想到dparsf最新的2.3版本可以自动调节角度，就换用2.3的版本。想问一下，这个调整角度，涉及那几个按键？applymats是要选的吧？reorient fun也是需要的？还有哪些吗？
3、因为数据比较残缺，很多被试都没有TI的数据，我试运行过几次，关于T1的和segment的都没选，normalise选的用EPI模版，这样选择有涉及T1的数据吗？如果您能告诉我一种既能解决头动又不涉及T1数据的选择最好了。
4、DATEL是一种分割方法吗？它也涉及T1的数据吗？如果用EPI模版做normalise是不是segment就已经包含在内，不用单独做segment了?
Forums
1. 如果只有4分钟，理论上应该也可以用。不过
1. 如果只有4分钟，理论上应该也可以用。不过，在发表文章的时候，有可能reviewer会提一些问题。你可以看一下"Yan, C.G., Cheung, B., Kelly, C., Colcombe, S., Craddock, R.C., Di Martino, A., Li, Q., Zuo, X.N., Castellanos, F.X., Milham, M.P., 2013. A comprehensive assessment of regional variation in the impact of head micromovements on functional connectomics. Neuroimage 76, 183-201." Figure S15, 大概3分钟往上就可以获得相对稳定的数据了。不过，下次在设计实验的时候，尽量往长一点设计。
2. reorient Fun*, reorient T1*，是改善配准的，并不能改善头动情况。具体操作，请参考rfmri.org/Course中文版第三部分Release 130425。
3. 头动校正与T1数据没有任何关系。
4. DARTEL是一种配准方法。需要T1数据。你现在没有T1数据，只用EPI模板做配准，和这些都没有关系。
超赣
严老师：
严老师：
是我用词不准确，我有仔细研究了一下教程，我要解决的问题就是想调整大脑的起始位置，因为有的比较歪。
我是这样设置参数的：
然后matlab会出现这样的错误：
??? Error using ==> rest_Fix_Read_Write_Error at 64
Meet error while fixing read write error. Please restart MATLAB, and run
"rest_Fix_Read_Write_Error" before starting anything.
Error in ==> rest_WriteNiftiImage at 92
rest_Fix_Read_Write_Error; %YAN Chao-Gan, 100426.
Error in ==> y_Reslice at 77
rest_WriteNiftiImage(OutVolume,OutHead,OutputFile);
Error in ==> DPARSFA_run at 2361
y_Reslice(Filename,DPARSF_Normalized_TempImage,[1 1 1],0);
Error in ==> DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1601
[Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);
Error in ==> gui_mainfcn at 96
feval(varargin{:});
Error in ==> DPARSFA at 33
gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});
??? Error while evaluating uicontrol Callback
然后我把applymats选上，出现这样的错误：
??? Error using ==> cd
Cannot CD to H:\data\Analysis\T1Img\sub101 (Name is nonexistent or not a directory).
Error in ==> DPARSFA_run at 315
cd([AutoDataProcessParameter.DataProcessDir,filesep,'T1Img',filesep,AutoDataProcessParameter.SubjectID{1}]);
Error in ==> DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1601
[Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);
Error in ==> gui_mainfcn at 96
feval(varargin{:});
Error in ==> DPARSFA at 33
gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});
??? Error while evaluating uicontrol Callback
applymats的作用是能自动调节脑的起始位置吗？我有试过把DownloadedReorientMats中的T1文件去掉，还是会出这样的问题，您看我怎么能解决这两个问题？
十分谢谢~~
1. 应该是你的临时文件夹的问题-
1. 应该是你的临时文件夹的问题--你的windows用户名可能比较奇怪。在matlab里面输入tempdir，回车看一下返回值是什么。
2. Applymats是针对网上下载数据使用的。你是自己的数据，不要选这项。如何调整，请参考我之前回复的第二条。