DPARSF 做到 smooth 的时候报错

我利用 DPARSF 来预处理我的功能像数据,每个患者有 3 个 session,因此我将 FunRaw 里面设置为 subject001_1、subject001_2、subject001_3...,而T1Raw里面相应的放上 3 个 subject001 的 3D 结构像、然后 subject002...
前面的步骤运行顺利,但是到 smooth 的时候,报了错,并且文件夹中未生成用于检验 normalization 效果的图像文件夹。
系统为win xp,spm8,刚更新了DPARSF 和 REST1.4,报错信息如下:

Taxonomy upgrade extras:

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用DPARSF做slice timing时报错

严老师,您好:
  我是一名神经病学的博士生,以往搞临床工作对fMRI不熟悉,最近开始准备做磁共振相关的课题。我从美德公司处找来这次在成都讲座发的学习资料,根据里面提供的软件(DPARSF-V1.0, REST2007V1.3, SPM5以及SPM5 Updates)在MATLAB 7.90(R2009b)平台上应用DPARSF对学习资料中的数据进行预处理,但是在进行到slice timing时出现了错误,下面一张图是我用DPARSF进行数据预处理的设置:

在按下Run运行后出现了报错:Removing First 10Time Points:Sub_001 OKRemoving First 10Time Points:Sub_002 OKRemoving First 10Time Points:Sub_003 OK

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A problem of REST GCA 1.0 Beta

 I am running the Granger Causality Analysis script contained in the REST 2007 toolbox. Unfortunately, I am encountering some errors.

The value of the generated GCA Map  is zero in every voxel.

Taxonomy upgrade extras:

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严老师,我是初学者有些问题请教!

严老师,我是左西年老师介绍后找到这个工具箱的。我第一次使用,有些问题请教。
1.是不是这个工具BOX转换数据的时候很慢?但是我用MRICRON转换起来还是很快的!
2.我在用DPARSF处理的时候,我创建的FunImg不能自动添加被试的数据,所以下面的所有操作都进行不了
3. 是不是添加一下您的第1个视频中讲的“演示视频”有些基础的东西我们这些初学者还是有必要认真学习的!
祝好!

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如何进行临床指标与 ROI 的 ALFF time course 之间的相关性分析?

通过患者组和正常受试者组的双样本 T 检验,找到了一些患者 ALFF 出现明显异常的区域。现在我想做这个明显异常区域中的 ALFF time course 与临床指标之间的相关性分析,我的做法如下:

  • 利用 add recursively all subfolders 加入了每一名患者的 detrended_filtered 静息态图像
  • 使用 user defined mask file 添加进一个我利用 rest slice viewer 保存的 ROI 图像。

输出的文件是每个被试一个 mat 文件,里面有 200 个 time course 文件(应该是对应的 200 个时间点的图像)。

我的问题:

Taxonomy upgrade extras:

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fALFF怎么翻译 ?是叫 分数低频振幅么 ?我在写中文文章。不知道怎么翻译。

fALFF怎么翻译 ?是叫 分数低频振幅么 ?我在写中文文章。不知道怎么翻译。

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Resting-state_fMRI_for_course_20100403_Chengdu

Attached is my presentation for the resting-state workshop in Chengdu, April 2-4, 2010. Thanks for your interest. Due to the system limitation, it was divided into two parts.

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how to calculate the z score of different regions if i ONLY know the mean time series of these regions?

How to calculate the z score of different regions if i ONLY know the mean time series of these regions?

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关于统计结果图的一个问题

严老师:
      您好!我使用静息态fMRI数据进行单样本T检验,得到的统计结果图见附件,想请教严老师一下,为什么这个结果图中中间Z的值也为-3mm?
      谢谢严老师!
      Best Wishes!

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Normalize using T1

 各位老师好

DPARSF的normalize选项中可以选择使用t1作分割,然后配准。请问这个t1是head image还是brain image。谢谢。

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