Error when running Dpasfa with BIDS-type data

Submitted by Qunjun on Mon, 10/31/2022 - 17:53

Hi Dpabi experts,

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dparsf的头动参数

Submitted by xiaoli11 on Sun, 10/30/2022 - 10:02

老师您好，

请问下rp_aSub_001里面的6例参数是 motion parameters吗？

我发现第一行都是0，会不会是后面一行减前一行得到的那种temporal dereivatives of motion parameters? 谢谢！

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BET went wrong for T1.nii that was flipped from left to right using Python-nibabel.

Submitted by Lena_Wang on Sun, 10/23/2022 - 07:56

Here is the problem. I need to flip some T1.nii data from left to right, making all lesion located in the left hemisphere. By using nibabel package by Python laguage, I got some flipped data.

However, when I running the BET function on those data within DPARSFA, it suggested : Not enough data in D:\Lena\000test\T1ImgBet\Sub_003\fBet_003BeforeBet.img.

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Predefined Types:

关于三组ANOVA的分析问题

Submitted by aniuaniu on Sun, 10/16/2022 - 15:11
ANOVA统计分析界面中，如果选择事后检验如bonferroni，那么就没法选择TFCE，只能直接进行RUN。那么此时得到的z图G1-G2是校正过的吗？如果是矫正过的，是否可以将此时的显著区域作为ROI提值？目前我是将此时的ROI提值了，但是提值得到的TXT里的值的数量为何与我的图像数量不符呢？我的G1-G2一共有40个，但是提出来TXT只有十几个值。这是为什么呢？

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The ALFF results appeared like grids

Submitted by Zhang.Wenlei on Sun, 10/16/2022 - 15:03

Hi Prof Yan/experts/users, 

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关于使用dpabi进行anova分析的问题

Submitted by CrystalLI on Sat, 10/15/2022 - 13:39

老师您好，我在应用dpabi软件进行数据处理时遇到了一些问题想请教一下。、

1.在应用dpabi进行anova分析时需不需要加入些变量（年龄、头动参数等），如果需要，我有三个组那协变量的txt是三个与组顺序相互对应还是整理到一个文件夹中？

2.我尝试用dpabi先跑过一次anova结果matlab显示开始进行多重比较矫正然后idle timeout has benn reached。我不太确定软件有没有进行多重比较矫正，但相应文件夹里已经生成了P、Z文件

3.在进行统计分析时mask的选择是必须的吗？还是说可选可不选。以及在GRF校正中选择不同的mask（dpabi自带3个不同的brain mask）其结果也不同，GRF的mask选择有要求吗，最后在勾选了GRF矫正后没有出现激活，但是调整团块大小出现了激活，那这时候算是GRF通过了还是没通过呢？

非常希望得到老师的帮助，麻烦老师了，谢谢老师！

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Inf values in

Submitted by James on Mon, 10/10/2022 - 18:55

Hi Prof Yan/experts/users, 

I had completed preprocessing in DPARSF and wanted to check what will be the reasons why I obtained "inf" values in my inf ROICorrelation_FisherZ.mat files. I have 116x116 and there are 116 "inf" values, please see screenshot of part of it: 

 

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如何把4Dfmri转换成2维，一维是时间，一维是体素个数呢？

Submitted by zhangzhuan on Fri, 09/30/2022 - 05:48

严老师您好：

        请问如何把4Dfmri转换成2维，一维是时间，一维是体素个数。我想把这个数据拿去做字典学习，更好的提取ROI。但是不知道怎么去转换这个。

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BrainImageNet Dataset

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 09/29/2022 - 07:27

BrainImageNet Dataset

 

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如何用DPABI计算半球内、对侧半球的功能连接密度

Submitted by 小马过河呀 on Thu, 09/15/2022 - 04:48

DPABI可以得到全球的功能连接密度，但怎么可以算出半球内和对侧半球的啊;是要用MEALAB写出算法和DPABI连接起来吗

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