用 voxel level FWE 的时候描述 cluster 大小

各位专家,您好

我在处理一些 Repeat Measure ANOVA 数据的时候,用了SPM

在结果数据的时候,我用的 voxel level FWE ,P<0.01 (FWE校正, 因为数据量大效应也挺明显,我把阈值做得比较低严)

然后,为了避免噪音和小的 cluster干扰,我设定cluster size 30, 然后审稿人误认为我是用了 cluster level 的FWE

我不知道怎样Revise 才好,不知道这样是否可以,多谢大家。

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ALFF Frequency Band Issue

Hello,

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在mixed effect analysis中运行PT+TFCE出错

运行环境:DPABI_V3.1_180801,MADLAB2017a,路径没有空格。以下是报告的错误详情:
 
Reading input 1/1: D:\multsite_MDD_Data\S20_tfce\Temp\DependentVolume.nii
Reading design matrix and contrasts.
Elapsed time parsing inputs: ~ 9.09439 seconds.
错误使用 palm_tree>checkblk (line 261)
Not al sub-blocks within an EB are of the same size at level 1.
 
 
出错 palm_tree>checkblk (line 239)
            checkblk(B(idx,2:end),B(find(idx,1),1)>=0,recdepth+1);

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关于normalization结果异常问题咨询

请问各位老师,用DPABI预处理以后得到的PicturesForChkNormalization文件夹中图像明显异常应当如何解决,具体如附件图片所示:

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work directory

Hi DPARSFer,

We used to use DPARSF_V2.3 to process rsfMRI data three years ago. When I set path "Working Directory", no participant is listed (showing) in "Participants". I have tried to set up a folder -  "FunImg/Subject001/.img/nii or a folder - "FunRaw/Subject001/.dicom".  What did I do wrong? Any advice would be greatly appreciated.

 

Best regards,

Xingbao Li

 

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关于DARTEL的疑惑

尊敬的各位老师,

         在用Dpabi做数据预处理时我们常用默认推荐的DARTEL做分割,然后配准到标准空间。但在了解一些DARTEL的知识后有了一个困惑:我所理解DARTEL是根据处理组中所有人的信息生成了specific template,然后基于这些template做配准。这样的活,如果我想在加入新的被试,那么我应该是将这个被试和之前已经处理的所有被试放在一组再重新处理一遍?毕竟上次处理DARTEL生成的specific template 并没有包含这个新来的被试信息。还是说只要将这个被试一个人重新做个预处理?这两种做法会有很大差异么?比如我想做个多站点的数据处理,由于不同站点的采集参数不同,我可能会将站点分开处理,这样应该每个站点都有自己的specific template,会对配准或分割有影响么?或者将分割前分站点处理,后面分割、配准到标准空间时再将所有站点放在一起处理?

          可能我对DARTEL的理解有错误,望老师们指正。

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ANOVA结果F.nii做GRF校正报错

老师,您好!我用dpabi做ANOVA,生成结果F.nii想做GRF校正报错,请问是什么原因呢?用FDR和AlphaSim校正都可以正常运行。

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Question about wAutomask

Dear all,

                Recently, I met some problems when I  used Dpabi for fMRI data preprocessing .

                1) Usually,after normalization,  error "Function 'subsindex' is not defined for values of class 'matlab.ui.Figure'." will be reported in matlab so that we couln't obtain PicturesForChkNormalization files. Our version of matlab is 2017b in Ubuntu 16.04, how do we work out this problem? Or what's recommend version  of matlab?

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