第一步一个是做"T1 Coreg to Fun",一个是做"Reorient T1*",第二步在“New Segment+DARTEL”生成的灰质、白质、脑脊液数据文件是相同的吗?

严老师,您好!

我在数据预处理中"Nuisance Covariates Regression"去除脑脊液、白质,所以通过"T1 Coreg to Fun"和“New Segment+DARTEL”这一步生成了灰质、白质、脑脊液的文件数据。

后面在做VBM中,通过dpabi默认的步骤"Reorient T1*"和“New Segment+DARTEL”也同样生成了,灰质、白质、脑脊液的数据文件。

请问这里第一步一个是做"T1 Coreg to Fun",一个是做"Reorient T1*",那在“New Segment+DARTEL”生成的灰质、白质、脑脊液数据文件是相同的吗?

谢谢!

Zhe

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预处理fMRI图像报错

严老师您好:

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preprocessing-pixelized image

 

 Dear Chaogan,

  I have a problem during doing data preprocessing using dpabi. The data is okay at the files under FunImgR (the first image below). However, it became pixelized starting from FunImgRC (the second image).  Any idea of what could have gong wrong? Thanks. 

 

用dparsfa做功能连接时报错

严老师,您好!

在使用dparsfa时,每次都出现以下报错是什么原因呀?

谢谢您的回答!祝身体健康!

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an error occured when using dparsfa

hello!

professor Yan, when i processed my data with dparsfa based on matlab2013a, spm12, an error always occured.

but i 'm sure that i had used same parameters processed data successfully once a time

just with smooth value change from 4mm to 6mm

here are the infor that shoewed in matlab :

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DICOM数据转化

严老师好:

我拿到的DICOM数据是每一个slice(比如有35个)上每一个TP(比如有240个)一个DICOM文件,一共8400个DICOM文件。老师展示的DeMo数据中的FunRaw中,是一个TP一个文件(共240个文件),请问应该如何将前面的8400个文件转化为后面的240个文件呢?

谢谢

Rest-AlphaSim

尊敬的老师:
      您好!我是一名研究生,在The R-fMRI Network网站上看到您关于AlphaSim校正的教学视频,有几个问题想向您请教。

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使用dpabi view进行surface view with BrainNet viewer时错误

按教程我在overlay中添加Yeo2011_17Networks_MNI152_FreeSurferConformed1mm_LiberalMask.nii.gz以及在Load colorbar from MAT中载入Yeo2011_7Networks_Colormap_ForDPABI等文件后,点击surface view with BrainNet viewer按钮,matlab运行框显示错误,我看不到我的图像结果(说明:已事先安装好brainnet viewer):

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关于用统计分析模块添加协变量的疑问

尊敬的严博士,我在用统计模块进行两个独立样本T检验时,在添加患者组和对照组后,还添加了Mean FD,性别,年龄,教育年限等协变量,但是我发现在点Run之后,并没有运行协变量,得到结果和我没有添加协变量时是一样的,我怀疑是我编辑的协变量文件不正确。例如我建立一个记事本文件(OCD.txt),假如我有13个被试,我就编辑成13行,4列;每一行从左到右以此是:性别,年龄,教育年限,Mean FD;打开后内容如下:

1 24 16 0.061
1 55 12 0.089
1 18 09 0.107
0 44 15 0.057
0 36 09 0.093
1 38 16 0.109
0 33 11 0.116
0 23 16 0.062
0 29 12 0.054
1 17 11 0.117
1 49 09 0.104
0 27 15 0.127
1 35 12 0.048
(想让老师们帮我看一下,我这个编辑的方式是不是有问题?感谢老师,我爱你们)

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关于用统计分析模块分析VMHC结果的疑问

结果如下:DLH 0.091699 voxels^-3 before correcting for temporal DOF

 

FWHMx = 3.744741 voxels

FWHMy = 3.687451 voxels

FWHMz = 3.645997 voxels

FWHMx = 11.234224 mm

FWHMy = 11.062353 mm

FWHMz = 10.937990 mm

DLH = 0.092841

VOLUME = 174972

RESELS = 50.345928

尊敬的严博士,关于这些结果我不是很明白,我想了解一下上面这些结果分别表示什么意思?感谢亲爱的严博士

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