brainGraph (graph theory analysis in R) major release: v2.0.0

Dear DPABI users,

I am pleased to announce the 2nd major release of my R package for graph theory analysis of brain MRI data, "brainGraph".
The main page on CRAN is at: https://cran.r-project.org/web/packages/brainGraph/index.html

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Realignment error - DPARSFA

Dear

I am getting the following error after trying to run realignment on DPARSF A:

 

 

Error using cfg_util (line 835)

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Realignment error - DPARSFA

Dear

I am getting the following error after trying to run realignment on DPARSF A:

 

 

Error using cfg_util (line 835)

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Fail in generating auto mask

hi Dr.Yan,

May I know why dparsfa 3.14 failed in  generating auto mask? Would you mind to help me with that?

Thanks in advance for your help.

best

fish

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DPABI中的IMAGE RESILCE 对灰质密度文件(WRP1)重采样后没有可用的密度数值

老师们好,我用DPABI中的IMAGE RESILCE 对灰质密度文件(WRP1)重采样后,无论目标的voxel size是多少,所得图片文件的各体素均没有可用的密度数值,只分为0或1,请问怎么解决?而对mwrp1文件进行处理是正常的。换了别人的电脑也一样。

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DPABI/DPARSF视频教程V2.2与DPABI/DPARSF特训营

近日,静息态功能磁共振数据处理教程V2.2正式上线。V2.2版课程主体为2017年12月13日-19日的第二届人脑连接组神经影像研讨班暨脑成像数据分析与论文撰写特训营的授课视频,加以剪辑修订,免费开放供相关研究人员学习。该版课程在内容全面性上为历次之最,不仅结合最新研究结果介绍了静息态功能磁共振的基本概念、常用计算方法、DPABI/DPARSFA使用等基础知识,而且根据特训营学员需要补充DPABI动物数据处理专题,更添加了备受关注的可重复性与多重比较矫正专题、R-fMRI动态性专题。 V2.2全部课程共10个专题已上传至http://rfmri.org/Course#Chinese,欢迎大家观看!

另外,由于大量用户反映在线教程学习缺乏互动,并且对于DPABI/DPARSF运行中的诸多报错不能得到有效解决,兹定于2018年3月24日至26日在中国科学院心理研究所举办为期三天的DPABI/DPARSF特训营(为DPABI/DPARSF国内独家授权培训)。

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GRETNA: Cannot find T1 image

Dear GRETNA experts:

I am using the latest GRETNA 2.0 with Matlab 2017b/SPM12 for Graph Theory Pre_processing.

OS: Ubuntu 16.0.4

Please see the attached screenshot for error message.

Thanks for considering my request.

Best regards

Larry

 

 

 

dpabi 3.0 使用小bug

严老师:

              感谢严老师辛勤付出,老师一直辛苦更新软件版本,方便我们这些普通使用者的学习使用。我最近跑任务态预处理时,发现使用dpabi3.0时,每次都是从原始数据转为nifti数据时,都是转换后,有个别被试的转换后的数据,被留在了funraw下被试的子文件夹下,即和原始数据在一起,funimag下没有相应的被试子文件夹。但是当我换为dpabi1712上个版本时,预处理就无这种错误。我使用的是spm12. 不知道这是什么原因? 是不是新出的版本兼容不好,但是我试了好几次都是i这样。

谢谢老师! 

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negative numbers for time courses

Dear R-fMRI Network team,
I am looking at the ROI Signals_ xxx which outputs the time courses for each ROI and I am surprised that some of these numbers are negative? Could you please explain why that would be the case?
With kind regards,
Catherine

DPABI standalone 3.0 启动报错

各位专家号,我的旧版本 DPABI standalone 2.3 一直运行稳定,但是新版本 3.0 升级了一直无法启动(我的笔记本 Thinkpad T470P, Win 10 操作系统,Matlab的 MCR 正常安装,运行 2.3 正常),报错截屏见附件,多谢指教!

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