用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错(2)

尊敬的严教授:

        您好!因为之前的帖子没法把图片贴到正文,所以我又开了个窗口,望理解。之前的帖子链接是:http://rfmri.org/content/%E7%94%A8dpabi%E5%A4%84%E7%90%86%E8%A2%AB%E8%AF%95%E7%81%B0%E8%B4%A8%E6%97%B6%EF%BC%8C%E8%BF%9B%E8%A1%8C%E5%88%B0roi-signal%E5%87%BA%E7%8E%B0%E4%BA%86%E6%8A%A5%E9%94%99

        您说是并行工具箱的问题,我重新下载了matlab又试了试。我做了两种尝试,但是都没有成功。老师,接下来咋办啊?

生成文件显示问题

         尊敬的严老师您好,我在使用dpabi做预处理的时候,发 现中间生成的文件不知道是否存在问题。如图一所示。

         1.为什么在FunImgAR->FunImgARC 这个过程,生成的文件(图一)显示像马赛克一样。这样是正常的吗? 如果是正常的话,我不想要这样的显示,想要所有预处理后的显示结果如图二那样,我应该取消哪步操作?

         2.dpabi 不能对功能像数据进行去头颅操作吗?

 

          对于第一个问题,我下来仔细又看了一次视频,AR->ARC 这个过程是做了去除噪声,但是这样就使得图像看上去像马赛克一样,如果我不做这一步可以吗?会不会有很大的影响?

          希望老师能够解答,感谢!

严老师,您好,dpabisurf的时候报错,不能跑,谢谢您

Conversion required 0.177000 seconds. 
Converting T1 Images:Sub_001 OK
Starting parallel pool (parpool) using the 'local' profile ...
connected to 6 workers.
Removing First 10 Time Points: Sub_001 OK
 
Converting DPARSFA to BIDS structure...
Parallel pool using the 'local' profile is shutting down.
Preprocessing with fmriprep, this process is very time consuming, please be patient...
bids-validator@1.4.0
 

DPABISurf报错信息

老师们好,我在进行DPABISurf的预处理时遇到了以下报错,这应如何处理?

Error using GCA in REST v1.8

Dear Yan and other professors, 

Forums:

请问被试内2*2设计的方差分析Dpabi能实现吗?

请问各位老师,被试内2*2设计的方差分析Dpabi能实现吗?

请教关于DPABISurf的一些问题

尊敬的老师们,您好!
        我想问下我已经在freesurfer中处理了皮质重建,可以用这个在freesurfer中处理了的数据在dpabisurfer进行后续数据处理吗?还有我想问下dpabisurf中的mask中的SurfLH,SurfRH、Volume是不是一般选默认的模板,可以为空吗?若为空的话,会有什么后果吗?期待老师的回复,万分感谢!
 
 
 
 
 

Mask Error in Temporal Dynamic Analysis

It requires a mask with size 61*73*61, and I used the default mask (BrainMask_05_61x73x61.img), but it still goes wrong. Why did this happen?

图像处理中的困惑

老师们好,我在处理一批图像,但是这些图像采集的不太好,主要是结构像、功能像图像信号不均匀,额叶整体信号很低,甚至肉眼难以分辨灰白质(听说当时MR机器出了点问题)。静息态图像配准标准化效果不好,但是做VBM分析分割、标准化的图像看起来还不错。另外部分图像相位编码方向可能是左右。

用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错

尊敬的严老师:

         您好!我在用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错,我尝试了好多操作也问了周围的同学,但是还是不行,麻烦老师帮忙看看我的设置是不是出现了问题,谢谢老师啦!

相关的设置信息和报错信息如图片所示,其中在sphere中坐标设置是选取了之前操作中跑出来的cluster中peak的坐标值(就是选的数值比较大的坐标值)

非常感谢老师在百忙之中的解答。

 

祝好!

志霞

设置信息如下:

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