第二届DPABI/DPARSF与静息态功能磁共振成像技术特训营通知

 

第二届DPABI/DPARSF与

静息态功能磁共振成像技术特训营通知

 

        功能磁共振成像特别是静息态功能磁共振成像(Resting-state functional Magnetic Resonance Imaging, R-fMRI)是目前重要的研究手段,应用极为广泛。然而静息态功能磁共振成像的数据分析是一项极为复杂的工作,困扰着许多研究者。中国科学院心理研究所The R-fMRI Lab严超赣研究员开发的静息态功能磁共振成像数据预处理助手(Data Processing Assistant for Resting-State fMRI, DPARSF)以及脑影像数据处理与分析平台(toolbox for Data Processing &Analysis of Brain Imaging, DPABI)具有一站式流水线处理功能,操作简单,功能强大,深受海内外研究者的欢迎。

        严超赣研究员已经免费在线发布了静息态功能磁共振成像数据处理视频教程(http://rfmri.org/Course#Chinese)。但在线教程学习缺乏互动,并且对于DPABI/DPARSF运行中的诸多报错不能有效解决。为了克服在线学习课程的缺点,帮助学员取得更好的学习效果,兹定于2018年8月4日至6日举办为期三天的第二届DPABI/DPARSF与静息态功能磁共振成像技术特训营(为DPABI/DPARSF国内独家授权培训)。

        本次DPABI/DPARSF特训营由严超赣研究员主讲,面向心理学、认知神经科学、生物医学工程学、临床医学等领域的科研人员和研究生,及希望在该领域进行深造的高年级本科生。在特训营中,学员将系统学习R-fMRI领域的基本概念以及DPABI/DPARSF软件的相关操作。更为重要的是,鼓励学员带着自己的项目和数据前来学习,与导师进行深入的研究项目讨论,带着研究问题对数据进行处理,接受手把手的系统科研培训,对得到的研究结果进行科学阐释

        本届特训营诚挚欢迎您的参与,期待在夏天与您在北京相见!

一、时间:2018年8月4日——2018年8月6日

二、地点:清华科技园阳光厅清华幸福科技实验室会议室

 

三、授课教师(http://lab.rfmri.org/People

Description: /Users/ChenXiao/Downloads/Yan_Photo.jpg严超赣 研究员

DPABI/DPARSF创始人,中国科学院心理研究所研究员,博士生导师,心理所磁共振成像研究中心副主任,脑功能成像实验室PI。2006年毕业于北京科技大学获学士学位,2011年毕业于北京师范大学获博士学位。随后赴美留学,在美国内森克兰精神病学研究所和纽约大学儿童与青少年精神病学系先后担任研究科学家(Research Scientist)和研究助理教授(Research Assistant Professor)职位。2015 年作为中国科学院“百人计划”研究员加入中国科学院心理研究所工作。严超赣博士的主要研究领域集中在静息态功能磁共振方法学、数据分析软件平台、脑自发活动机制及其在脑疾病中的应用。他为一系列困扰静息态功能磁共振成像的方法学问题提出了广受领域认可和引用的解决方案,包括头动、标准化和多重比较校正等。他还对静息态功能磁共振成像的计算方法进行了规范化,建立了被引1400余次的脑成像流水线式计算平台DPARSF,并建立了脑成像分析与共享平台DPABI。他将静息态功能磁共振成像应用于抑郁症研究,发现了早期不良抚育可致大脑自发活动异常发育,与后期抑郁样行为有关。他在国际主流学术期刊(如Cerebral Cortex, NeuroImage, Human Brain Mapping, Translational Psychiatry, Neuroinformatics, Molecular Psychiatry 等)共发表48篇学术论文,其中17篇为第一作者和/或通讯作者。研究成果得到国际同行的高度关注,总引用7000余次,h指数27(Google Scholar),并有3篇第一/通讯作者论文入选ESI Top 1%高被引论文。他是《Frontiers in Psychiatry》客座副主编,国际人脑图谱学会通讯委员会(OHBM Communications Committee)委员。

助教:The R-fMRI Lab成员(http://lab.rfmri.org/People

四、授课内容

日期

时间

授课内容

8月4日

上午(9:00~12:00)

开营仪式

静息态功能磁共振原理与数据分析

静息态功能磁共振在心理学和脑疾病的应用

下午(14:00~17:00)

学员项目介绍

R-fMRI数据预处理:DPARSF

晚上(19:00~21:00)

软件安装与手把手操作练习

8月5日

上午(9:00~12:00)

R-fMRI质量控制与The R-fMRI Maps Project

DPABI动物数据处理

R-fMRI动态性分析

统计分析、多重比较校正与结果显示

下午(14:00~17:00)

DPABI统计分析实战

晚上(19:00~21:00)

学员自有数据处理

8月6日

上午(9:00~12:00)

R-fMRI可重复性及多重比较校正选择

DPABI Utilities介绍

下午(14:00~17:00)

学员项目结果汇报

 

五、学员要求

        学员对象为心理学、医学、生物学、计算机、教育学等领域的教研人员、研究生或高年级本科生。为保证学习质量,培训班参加人员总数限制为30 名。

        参加培训人员需自带笔记本电脑并提前安装好DPABI/DPARSF软件及示例数据(推荐携带自有数据),具体说明可查阅:

        http://rfmri.org/DPABI

        http://www.rfmri.org/DemoData

六、学费和报名方式:

        人民币4000元/人。费用包括会议服务费、培训费、材料费和场地费。交通食宿自理。

        请填写“第二届DPABI/DPARSF特训营回执”并发送至chenxiao@psych.ac.cn完成报名;或者微信扫描下方二维码在手机上填写信息完成报名。

七、交通及住宿

1. 机场到达:

        乘坐 机场大巴中关村线 从首都机场t3航站楼站 上车,到 清华科技园站 下车;

        乘坐 地铁机场线 从 t3航站楼站 上车,到 三元桥站 换乘 地铁10号线(外环) 至 知春路站 换乘 地铁13号线 至 五道口站下车。

2. 高铁到达:

        乘坐 地铁4号线大兴线 从 北京南站 上车 到 西直门站 换乘地铁13号线至 五道口站 下车。

八、联系人

陈骁:18519697812;chenxiao@psych.ac.cn

      微信扫码报名

 

附:第一届DPABI/DPARSF特训营回顾

        2018年3月24日至3月26日,第一届DPABI/DPARSF与静息态功能磁共振成像特训营在中国科学院心理研究所成功举办。本届特训营由中国科学院心理研究所磁共振成像研究中心副主任、“百人计划”研究员、DPABI/DPARSF创始人严超赣进行授课,带领学员由浅入深地夯实理论基础,拓展研究视野,将理论与实践相结合,对使用DPABI/DPARSF进行科研实践进行深度训练,展开了为期三天的集训。

        24日上午特训营的开营仪式由严超赣研究员主持。严老师详细介绍了开办本次特训营的目的。从一开始,DPABI/DPARSF的设计初衷就是使静息态功能磁共振成像数据处理流水线化、自动化,减少操作者的学习负担,使得相关研究者(包括临床医生、机器学习研究者)无需了解繁琐的磁共振成像处理参数设置细节,就能够利用磁共振成像领域最新的研究方法和最科学的处理参数对其科学问题进行高效严谨的研究。但是,严老师在长期通过论坛和微信群进行技术支持时发现,许多使用者由于一些非普遍的原因在软件使用过程中出现错误,往往很难通过邮件、论坛等方式快速解答,造成了研究效率的下降和出现潜在错误的可能性。希望能通过这次培训班,借助创始人的现场讲解和及时答疑解惑,辅以经验较为丰富的助教团队,帮助大家一次性解决使用过程中的各种问题,快速上手,加速研究进程。随后特训营开始了关于《静息态功能磁共振原理和数据分析》、《静息态功能磁共振在心理学和脑疾病中的应用》等课程。

        24日下午,特训营进行了个性化的学员项目介绍。每个学员对自己的实验设计、被试类型、感兴趣研究方向进行了一一介绍,严老师对每个人的课题进行了一定的指导,过程中学员们也进行了相互探讨。随后几天的特训营由现场教学和实际操作相结合。26日特训营最后一天下午,学员对自己的学习进展和数据处理结果进行了展示。绝大部分学员成功地利用示例数据完成了整套数据预处理、指标计算、统计检验、多重比较矫正等分析,并进行了作图;通过几天的学习,快速完成了软件上手和下一步研究思路的梳理,表示在回到研究单位后能迅速利用DPABI推进结果处理。还有部分学员在自己的实验数据上计算得到了相应的结果,并进行了作图呈现,结果与研究假设较为相符,展现出了初步的科学意义。

        本届“DPABI/DPARSF与静息态功能磁共振成像特训营”帮助神经科学、心理学、医学等诸多领域的研究者拓展了研究思路,夯实了理论基础,掌握了DPABI/DPARSF操作,解决了软件使用过程中最难攻克的疑难杂症,得到了学员的一致好评。

 

严超赣研究员主持开营仪式

严超赣研究员进行授课

学员个人项目介绍

特训营学员合影

 

 

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